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五源河濕地地理位置優(yōu)越，水資源充足，森林茂盛，鳥(niǎo)類有著優(yōu)越的生存空間。但由于種類和數(shù)量季節(jié)性變化大，冬季境內(nèi)均呈現(xiàn)出鳥(niǎo)類種類和數(shù)量的高峰期。這與這里的河流濕地、湖泊、淡水泉以及水稻田等濕地類型豐富有直接關(guān)系。此外，濕地苦楝樹(shù)、小葉榕等，喬木和灌叢也較為稠密，適于小型猛禽、攀禽、鳴禽棲息和繁殖。

濕地內(nèi)的山雀科、杜鵑科等10余科鳥(niǎo)類大多數(shù)是食蟲(chóng)鳥(niǎo)，占鳥(niǎo)類較大的比例；鷹科、隼科的7種鳥(niǎo)類都是食肉鳥(niǎo)；以植物種子為主食的雀科等鳥(niǎo)類盡管比例較少，且體型小，但數(shù)量龐大，繁殖量高。此外，還有一些以植物種子和果實(shí)為食的鳥(niǎo)類，在自然界的自然更新中也扮演著傳播種子的角色。因此，鳥(niǎo)類的生態(tài)學(xué)作用極其重要。

由于具有良好的棲息場(chǎng)所和食物來(lái)源，五源河濕地的爬行類、兩棲類和魚(yú)類也十分豐富，據(jù)調(diào)查，已在這里發(fā)現(xiàn)爬行動(dòng)物有4科8種，其中，壁虎科2種，鬣蜥科2種，石龍子科1種，游蛇科3種。所有爬行類均為《國(guó)家保護(hù)的有益的或者有重要經(jīng)濟(jì)、科學(xué)研究?jī)r(jià)值的陸生野生動(dòng)物》物種。谷峰透露，大多數(shù)爬行類動(dòng)物對(duì)人類都是有益的，對(duì)維持濕地生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定有著重要意義，且爬行類動(dòng)物在食物鏈上處于重要位置，保護(hù)好爬行類至關(guān)重要。

五源河濕地的魚(yú)類發(fā)現(xiàn)29種，其中，鯉科14種，占魚(yú)類總種數(shù)的48.28%。此外，入?？诙紊钪喾N適合咸水和淡水交匯環(huán)境的海魚(yú)種類。據(jù)了解，魚(yú)類在維持濕地生態(tài)系統(tǒng)平衡方面扮演著重要的角色，對(duì)評(píng)價(jià)濕地生態(tài)系統(tǒng)具有重要的指示作用和價(jià)值。不少魚(yú)類由于對(duì)水質(zhì)要求極高，故可作為水質(zhì)指示劑。此外，五源河流域水環(huán)境差異明顯，入海口還有對(duì)滲透壓變化適應(yīng)的魚(yú)類分布。