礦床地球化學國家重點實驗室是在中國科學院礦床地球化學重點實驗室的基礎(chǔ)上建立起來的。2006年8月通過專家論證，經(jīng)科技部批準實驗室進入建設(shè)階段。2009年8月實驗室通過了由科技部組織的專家組驗收。

礦床地球化學國家重點實驗室以礦床地球化學研究為主線，具體研究方向包括（1）重要成礦區(qū)帶和特殊成礦系統(tǒng)的成礦作用；（2）成礦作用的理論和實驗模擬；（3）重要礦產(chǎn)成礦預測理論和方法；（4）礦產(chǎn)資源綜合利用及礦山開發(fā)的環(huán)境效應四個方面。

環(huán)境地球化學國家重點實驗室（簡寫：SKLEG）前身為中國科學院地球化學研究所環(huán)境地質(zhì)研究室。1989年由國家計委批準利用世界銀行貸款在研究所環(huán)境地質(zhì)研究室的基礎(chǔ)上組建環(huán)境地球化學國家重點實驗室，1991年中國科學院批準正式對國內(nèi)外開放，1995年10月建成并通過國家驗收。

環(huán)境地球化學國家重點實驗室主要研究地球表面各圈層之間的物質(zhì)循環(huán)的生物地球化學過程及其生態(tài)和環(huán)境效應；有害物質(zhì)遷移、轉(zhuǎn)化規(guī)律及其控制機理等。揭示物質(zhì)生物地球化學循環(huán)與生態(tài)環(huán)境變化、地球化學環(huán)境與人體健康、地球過去氣候和環(huán)境變化與人類社會發(fā)展等方面等關(guān)系。