醫(yī)院信息管理系統(tǒng)（History Information System，簡稱HIS）就是普通信息管理系統(tǒng)在醫(yī)院中的應用。它包括了醫(yī)院日常工作流程，比如掛號，劃價，收費，病區(qū)，藥房，設備等日常信息管理。

電子病歷（Electronic medical record，簡稱EMR）是管理維護和分析病歷信息的，病歷信息就是病人在醫(yī)院整個診斷治療過程的所有的原始記錄，包括病案首頁，病程記錄，檢查檢驗結果，手術護理記錄，還包括治療之后的回訪記錄等等。

HIS和電子病歷雖然都是為醫(yī)療機構服務的。但有著很大的區(qū)別，其中最大區(qū)別在于側重點不同，HIS以錢為中心，而電子病歷以病人為中心。對于醫(yī)療機構來說，HIS是對外的信息系統(tǒng)，而電子病歷是對內的信息系統(tǒng)。