早在5000年前的新石器時代，莆田境內(nèi)已有人類活動。隋開皇九年（589）置莆田縣，不久即廢。唐武德五年（622）再置莆田縣，屬豐州（州治今南安豐州）。清沿明制，興化府建制不變，仍轄莆田、仙游兩縣，隸屬福建省閩海道。民國二年（1913年），撤銷興化府，莆田、仙游兩縣屬福建省南路道管轄。民國三年（1914年），實行省、道、縣三級制，莆田、仙游兩縣屬廈門道管轄。1983年9月9日，國務(wù)院批準設(shè)立地級莆田市。

截至2023年12月31日，莆田市轄四區(qū)一縣：城廂區(qū)、涵江區(qū)、荔城區(qū)、秀嶼區(qū)、仙游縣。